Melhor software de faturação: qual escolher para o seu negócio?

Escolher um software de faturação pode parecer simples até começarmos a comparar funcionalidades.

Há soluções gratuitas, programas especialmente pensados para trabalhadores independentes, plataformas que integram faturação e contabilidade e sistemas preparados para comunicar diretamente com uma loja online.

Então, qual é o melhor software de faturação para uma empresa ou trabalhador independente?

A resposta depende essencialmente do tipo de atividade, do volume de documentos emitidos, da necessidade de gerir stocks, da existência de uma loja online e da forma como a empresa trabalha com o seu contabilista.

Neste guia analisamos algumas das soluções de faturação mais conhecidas em Portugal, as suas principais vantagens e os aspetos que deverá ponderar antes de escolher.

Nota: esta não pretende ser uma lista exaustiva nem uma classificação das plataformas. As funcionalidades e condições comerciais podem ser alteradas pelos respetivos fornecedores, pelo que recomendamos confirmar sempre a informação atualizada no website de cada solução.

O que deve analisar antes de escolher um software de faturação?

O preço é importante, mas dificilmente deverá ser o único critério.

Antes de escolher um programa de faturação, considere:

  • se o programa está certificado pela Autoridade Tributária, quando essa certificação é aplicável ao seu negócio;
  • facilidade de utilização;
  • possibilidade de utilização online e em diferentes dispositivos;
  • comunicação de documentos à Autoridade Tributária;
  • gestão de clientes e fornecedores;
  • gestão de artigos e stocks;
  • integração com lojas online;
  • integração com plataformas de pagamento;
  • emissão automática de documentos;
  • relatórios de gestão;
  • ligação ou partilha de informação com o contabilista;
  • existência de API ou integrações com outros programas;
  • suporte técnico;
  • custos mensais e custos adicionais associados a módulos ou integrações.

A Autoridade Tributária disponibiliza uma lista oficial de programas de faturação certificados, que pode ser consultada antes de tomar uma decisão.

1. weoInvoice — uma opção de faturação gratuita

O weoInvoice apresenta-se como um sistema de faturação online certificado pela Autoridade Tributária e disponibiliza uma solução base gratuita.

Pode ser particularmente interessante para trabalhadores independentes, pequenos negócios ou empresas que procuram começar a utilizar um programa de faturação sem assumir imediatamente uma mensalidade elevada.

Principais vantagens do weoInvoice:

  • Existe uma modalidade base gratuita;
  • Funciona online;
  • Permite gerir clientes, fornecedores, artigos e faturação;
  • Inclui dashboard e informação sobre valores faturados, em dívida ou vencidos;
  • Tem solução POS;
  • Disponibiliza aplicação móvel;
  • Atualmente disponibiliza integrações com Shopify e WooCommerce, entre outras soluções.

Para negócios digitais, tornou-se uma opção especialmente interessante com a disponibilização das integrações com Shopify e WooCommerce em 2025 e 2026.

Aspetos a considerar

Apesar de existir uma solução gratuita, algumas funcionalidades, integrações e módulos complementares são pagos. Por isso, é importante verificar se aquilo de que o negócio necessita está efetivamente incluído na modalidade gratuita ou exige a contratação de módulos adicionais.

Pode fazer sentido para: freelancers, trabalhadores independentes, pequenas empresas e negócios que procuram uma solução de faturação económica e relativamente simples.

2. Moloni — especialmente interessante para lojas online

O Moloni é uma das soluções de faturação online mais conhecidas em Portugal e destaca-se pela quantidade de ferramentas de gestão e, particularmente, pelas possibilidades de integração com comércio eletrónico.

Para quem vende online, esta é uma característica importante.

O Moloni disponibiliza plugins para diferentes plataformas de e-commerce e permite automatizar tarefas relacionadas com encomendas, documentos, clientes, produtos e stocks.

Existem, por exemplo, soluções para WooCommerce/WordPress, PrestaShop, Shopify e outras plataformas de comércio eletrónico.

Principais vantagens do Moloni:

  • Boa capacidade de integração com lojas online.
  • Emissão automática de documentos a partir das encomendas.
  • Sincronização de artigos e stocks em algumas integrações.
  • Gestão de clientes.
  • Gestão de produtos e inventário.
  • API para integrações personalizadas.
  • Adequado a negócios com maior volume de vendas online.

No WooCommerce, por exemplo, a integração pode permitir criar documentos automaticamente, criar notas de crédito e sincronizar produtos e stocks.

Aspetos a considerar

As integrações e funcionalidades disponíveis dependem do plano contratado. No caso do plugin para WordPress/WooCommerce, por exemplo, o próprio Moloni indica atualmente a necessidade de uma conta com plano Flex ou Pro.

Também é uma plataforma com mais possibilidades de configuração do que um simples emissor de faturas, o que pode significar alguma aprendizagem inicial para quem pretende apenas emitir alguns documentos por mês.

Pode fazer sentido para: lojas online, empresas com stocks, comércio e negócios que pretendem automatizar faturação e encomendas.

3. InvoiceXpress — simplicidade e muitas integrações

O InvoiceXpress é outro dos programas de faturação online mais conhecidos em Portugal.

A plataforma aposta particularmente na facilidade de utilização e na automatização da faturação. É certificada pela Autoridade Tributária e disponibiliza API e diferentes plugins para integração com outras plataformas.

Principais vantagens do InvoiceXpress

  • Interface orientada para uma faturação relativamente simples;
  • Software online;
  • API disponível;
  • Grande variedade de integrações;
  • Possibilidade de automatizar a criação de documentos;
  • Integração com diferentes plataformas de e-commerce.

Para lojas online existem integrações com soluções como WooCommerce, Shopify, PrestaShop e outras plataformas.

Isto significa que uma encomenda efetuada numa loja online pode originar automaticamente a emissão do respetivo documento, reduzindo tarefas administrativas manuais.

Aspetos a considerar

É particularmente forte enquanto solução de faturação e automação. Empresas que procuram um ERP muito abrangente, com processos internos complexos, poderão necessitar de avaliar funcionalidades complementares ou comparar com plataformas de gestão empresarial mais extensas.

Também deverá confirmar quais as integrações incluídas e eventuais custos associados ao software ou aos plugins utilizados.

Pode fazer sentido para: empresas de serviços, freelancers, pequenas e médias empresas e lojas online que valorizem facilidade de utilização e automação.

4. TOConline — quando a faturação e a contabilidade trabalham em conjunto

O TOConline tem uma abordagem diferente.

Trata-se de uma solução da Ordem dos Contabilistas Certificados que integra faturação, contabilidade e gestão empresarial numa única plataforma.

Uma das suas principais vantagens é precisamente a colaboração entre empresa e contabilista.

Em vez de a faturação funcionar como um sistema completamente independente da contabilidade, a informação pode fazer parte de um ecossistema comum.

Principais vantagens do TOConline

  • Integração entre faturação e contabilidade;
  • Gestão de stocks;
  • Gestão de compras;
  • Controlo de custos;
  • Informação partilhada entre empresa e contabilista;
  • Integração com e-Fatura e SAF-T;
  • API para integração com outros sistemas.

Esta centralização pode representar uma vantagem significativa para empresas que pretendam reduzir a duplicação de informação e facilitar o acompanhamento contabilístico.

Aspetos a considerar

Existe uma particularidade importante: o TOConline está disponível para subscrição por contabilistas certificados. Se for empresário, deverá solicitar ao seu contabilista uma licença ou acesso à plataforma.

Por isso, a escolha do TOConline deve ser analisada em conjunto com o profissional ou gabinete responsável pela contabilidade da empresa.

Pode fazer sentido para: empresas que valorizem especialmente a integração entre gestão, faturação e contabilidade e que trabalhem com um contabilista que utilize a plataforma.

5. Portal das Finanças — para recibos verdes e situações mais simples

Nem todos os profissionais necessitam imediatamente de contratar um programa de faturação.

Para muitos trabalhadores independentes que emitem recibos verdes, o próprio Portal das Finanças poderá ser suficiente.

A Autoridade Tributária permite emitir através do Portal:

  • faturas;
  • recibos;
  • faturas-recibo.

Existe ainda a aplicação ATGO, destinada à gestão da atividade profissional, através da qual é possível emitir e consultar faturas, recibos e faturas-recibo e acompanhar alguns indicadores da atividade.

Principais vantagens

  • Não exige a contratação de um software de faturação;
  • Está diretamente integrado no ecossistema da Autoridade Tributária;
  • Adequado para emissão de recibos verdes;
  • Pode ser suficiente para profissionais com uma atividade administrativa simples.

Aspetos a considerar

O Portal das Finanças não pretende substituir um software completo de gestão empresarial.

Quem necessita de funcionalidades como gestão avançada de clientes, stocks, integração automática com uma loja online, CRM, automatizações ou relatórios de gestão mais completos encontrará normalmente mais possibilidades num software especializado.

Pode fazer sentido para: trabalhadores independentes e profissionais com um número reduzido de operações e necessidades de gestão simples.

6. Cegid Vendus — faturação e POS para comércio e restauração

O Cegid Vendus combina faturação online com funcionalidades especialmente orientadas para pontos de venda.

A solução é apresentada para áreas como escritórios, comércio a retalho, restauração, trabalhadores independentes e freelancers.

Principais vantagens

  • Faturação online;
  • Solução POS;
  • Gestão de clientes;
  • Relatórios;
  • Conta corrente de clientes;
  • Utilização em diferentes tipos de equipamentos;
  • Integrações com outras plataformas.

O Vendus disponibiliza também integrações destinadas a negócios digitais, incluindo integração com WooCommerce.

Aspetos a considerar

É uma solução particularmente interessante quando existe um ponto de venda ou uma componente forte de comércio e atendimento ao público.

Empresas que pretendam processos de gestão, contabilidade ou e-commerce multicanal muito complexos deverão comparar as funcionalidades necessárias com outras soluções mais abrangentes.

Pode fazer sentido para: comércio, restauração, lojas físicas, serviços e negócios que necessitem de POS.

7. Cegid Jasmin — faturação integrada numa gestão mais completa

O Cegid Jasmin vai além da emissão de faturas e apresenta-se como uma plataforma de gestão cloud.

Permite acompanhar faturação, compras, despesas, inventário, armazéns e tesouraria dentro do mesmo sistema.

É também particularmente relevante para negócios com vários canais de venda.

Principais vantagens

  • Faturação integrada com gestão empresarial;
  • Gestão de compras e vendas;
  • Controlo de inventário e armazéns;
  • Tesouraria;
  • Gestão multicanal;
  • Integração com e-commerce;
  • Possibilidade de colaboração com o contabilista.

No comércio eletrónico, o Jasmin permite centralizar encomendas, devoluções, stocks, artigos e preços provenientes de diferentes canais de venda. Existem integrações com plataformas como Shopify e WooCommerce e marketplaces, dependendo da configuração utilizada.

Aspetos a considerar

A maior abrangência funcional pode não ser necessária para um trabalhador independente que procure apenas emitir algumas faturas.

É importante comparar os diferentes planos e perceber quais os módulos e integrações efetivamente necessários para o negócio.

Pode fazer sentido para: PME, empresas com inventário, negócios multicanal e organizações que pretendem centralizar faturação e gestão.

8. Cegid PHC GO — para empresas que procuram uma solução mais abrangente

O Cegid PHC GO é outra alternativa a considerar quando a empresa procura algo mais amplo do que um programa exclusivamente dedicado à faturação.

A plataforma disponibiliza várias integrações e add-ons e permite a ligação a diferentes aplicações utilizadas pelas empresas.

Principais vantagens

  • Gestão empresarial integrada;
  • Faturação;
  • Gestão de clientes, artigos e encomendas;
  • Stocks;
  • APIs;
  • Grande ecossistema de extensões e integrações;
  • Possibilidade de integração com comércio eletrónico.

A solução contempla integrações com plataformas como WooCommerce, PrestaShop, ShopKit e outras soluções de e-commerce, dependendo do plano e configuração escolhidos.

Aspetos a considerar

Uma plataforma deste tipo poderá ser excessiva para quem apenas pretende emitir documentos simples.

Além do plano base, algumas funcionalidades e integrações podem implicar add-ons ou custos adicionais, pelo que é particularmente importante definir previamente aquilo de que a empresa realmente necessita.

Pode fazer sentido para: PME com necessidades de gestão mais completas, empresas em crescimento e organizações que pretendam integrar diferentes áreas do negócio.

Qual é então o melhor software de faturação?

Não existe uma resposta universal.

Uma forma simples de começar a escolha poderá ser esta:

NecessidadeSoluções a considerar
Programa de faturação gratuitoweoInvoice
Recibos verdes e atividade simplesPortal das Finanças / ATGO
Loja online / e-commerceMoloni, InvoiceXpress, Cegid Jasmin, PHC GO, weoInvoice
WooCommerceMoloni, InvoiceXpress, Vendus, Cegid Jasmin, PHC GO, weoInvoice
ShopifyMoloni, InvoiceXpress, Cegid Jasmin, weoInvoice
PrestaShopMoloni, InvoiceXpress, PHC GO
Integração próxima com a contabilidadeTOConline
Comércio ou restauração com POSVendus
Gestão empresarial mais abrangenteCegid Jasmin, PHC GO
Automação através de APIMoloni, InvoiceXpress, TOConline, PHC GO

Esta comparação deve ser entendida como um ponto de partida. A compatibilidade e as funcionalidades disponíveis deverão ser confirmadas diretamente com cada fornecedor antes da contratação.

Para uma loja online, qual software de faturação escolher?

Quando existe uma loja online, a capacidade de integração torna-se um dos critérios mais importantes.

Emitir manualmente uma fatura por cada encomenda pode funcionar quando existem poucas vendas. À medida que o negócio cresce, torna-se uma tarefa repetitiva, consome tempo e aumenta a possibilidade de erros.

Por isso, procure perceber se o software escolhido consegue comunicar diretamente com a plataforma de e-commerce que utiliza — WooCommerce, Shopify, PrestaShop ou outra.

Idealmente, a integração deverá permitir automatizar processos como:

  • criação do cliente;
  • importação da encomenda;
  • emissão da fatura;
  • envio do documento ao cliente;
  • atualização do stock;
  • criação de notas de crédito em caso de devolução.

Quanto mais informação circular automaticamente entre a loja e o programa de gestão, menor será a necessidade de repetir tarefas administrativas.

E a ligação com a contabilidade?

Este é um dos aspetos que por vezes é esquecido no momento de escolher o programa.

A faturação não existe isoladamente.

Os documentos emitidos, compras, despesas, movimentos bancários, inventários e restantes dados da empresa acabam por ter impacto na contabilidade.

Por isso, antes de contratar uma solução, poderá ser útil perguntar ao seu contabilista:

“Qual é o software que nos permite trabalhar de forma mais eficiente em conjunto?”

Uma plataforma ligeiramente mais cara pode acabar por representar uma poupança significativa de tempo se reduzir introdução manual de informação, troca de documentos e duplicação de tarefas.

Antes de decidir, fale com o seu contabilista

A escolha de um software de faturação não deve depender apenas do preço ou da popularidade da plataforma.

Um trabalhador independente que emite cinco documentos por mês tem necessidades completamente diferentes de uma loja online que processa centenas de encomendas, tal como uma empresa com vários armazéns necessita de ferramentas diferentes de uma pequena empresa de serviços.

Na Contabilidade 360, acreditamos que a tecnologia deve simplificar a gestão da empresa e facilitar a relação entre o empresário e a contabilidade.

Antes de escolher, mudar ou integrar um software de faturação, avalie as necessidades presentes do negócio — mas também aquilo de que poderá necessitar à medida que a empresa cresce.

Precisa de ajuda para perceber qual a solução mais adequada à organização e à contabilidade da sua empresa? Fale com a equipa da Contabilidade 360.

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